2016年9月14日 更新

画像解析入門⑤ ImageJの基本画面とメニュー構成

今回は画像解析の第5回目です。今回は主にImage J(Fiji)がどんなことが出来るのか?ソフトウェアの機能についてご紹介します。

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教材

今回は、「Image Jを使った画像解析実習-2値化・領域抽出」から、基本画面とメニューについて紹介していきます!

Image Jの基本メニュー

 (390)

まず、ImageJでのおおまかな解析の流れを見ていきます。撮影して得られた画像ファイルをImage Jで開き、輝度コントラストを調べ、白黒画像に編集して、輪郭から大きさ、幅、形について調べていきます。

これは、例えば、生き物の細胞や組織であれば、一旦扱える形まで遠心分離して、電子顕微鏡などで分子構造を調べる ことになるでしょうか。
 (392)

Image Jには様々なツールがあります。詳しくは原文をご覧下さい。まずArea selection tools(範囲選択ツール)です。

Rectangle(四角形)では、四角形の範囲で、画像の一部を選択することが出来ます。また、コマンドキーを押しながらだと、

中心を変えずに、縦横の範囲を変更することが出来ます。
 (394)

他にも、Oval(楕円),Selection Brush(自由選択),Polygon(多角形)などがあります。色々使ってみて下さい!

また、選択するだけでなく、Editを開いてみましょう!

次にLineツールを見ていきます。これは頻繁に利用するツールだと思います。こんな風に黄色い直線を引くことが出来ます。
 (396)

また、作成したLineから,Analyze->Plot Profileによって、直線上の輝度情報を得ることが出来ます。
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